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Text File  |  1995-03-04  |  3.4 KB  |  69 lines
  1. ***************************************************
  2. * G-protein coupled receptors family 3 signatures *
  3. ***************************************************
  4.  
  5. Glutamate and  calcium  bind  to  G-protein  coupled    receptors  that, while
  6. structurally similar to the majority of G-protein coupled receptors (R7G) (see
  7. the relevant  section),  do  not  show  any  similarity  at the level of their
  8. sequence, thus  representing  a  new  family  whose  current known members are
  9. listed below:
  10.  
  11.  - The  metabotropic  glutamate  receptors  which evoke a variety of function,
  12.    such as  long-tern  potentiation,  memory  acquisition  and learning, etc.,
  13.    through the  modulation  of  intracellular effectors [1,2]. Currently there
  14.    are seven known  subtypes  of  metabotropic glutamate  receptors; mGluR1 to
  15.    mGluR7. The  sutbypes  mGluR1  and mGluR5 are coupled to the stimulation of
  16.    the phosphatidylinositol-calcium  second  messenger  system  while  mGluR2,
  17.    mGluR3, mGluR4,  mGluR6  and  mGluR7 are coupled to G proteins that inhibit
  18.    adenylate cyclase activity.
  19.  - The extracellular calcium-sensing receptor [3]  which  sense changes in the
  20.    extracellular concentration of calcium ions.  The activity of this receptor
  21.    is coupled  to  the  stimulation of the phosphatidylinositol-calcium second
  22.    messenger system.
  23.  
  24. Structurally these receptors are composed of:
  25.  
  26.  a) A signal sequence;
  27.  b) A  very  large  hydrophilic extracellular region of about 540 to 600 amino
  28.     acid  residues. This region contains 17 conserved cysteines which could be
  29.     involved in disulfide bonds;
  30.  c) A region of about 250 residues that  seem  to  contain seven transmembrane
  31.     domains;
  32.  d) A C-terminal cytoplasmic domain of variable length (50 to 350 residues).
  33.  
  34. There are quite a number of regions of high sequence conservation both  in the
  35. N-terminal domain  and  in the region containing the transmembrane domains. We
  36. have selected  three  of  these  conserved  regions as signature patterns. The
  37. first one corresponds to a highly conserved hydrophobic segment in the central
  38. part of  the  N-terminal  extracellular  region.  The  second corresponds to a
  39. section that contains a cluster of six cysteines in the C-terminal part of the
  40. extracellular domain.  The  last one corresponds to the C-terminal part of the
  41. cytoplasmic loop between the fifth and sixth transmembrane domains.
  42.  
  43. -Expert(s) to contact by email: Kolakowski L.F. Jr.
  44.                                 lfk@receptor.mgh.harvard.edu
  45.  
  46. -Consensus pattern: V-x-N-[LIVM](2)-x-L-F-x-I-P-Q-[LIVM]-[STA]-Y-[STA](4)
  47. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  48. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  49.  
  50. -Consensus pattern: C-C-[FYW]-x-C-x(2)-C-x(4)-[FYW]-x(2,4)-D-x(2)-[TA]-C-x(2)-
  51.                     C
  52. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  53. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  54.  
  55. -Consensus pattern: F-N-E-A-K-x-I-[STAG]-F-[ST]-M
  56. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  57. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  58.  
  59. -Last update: June 1994 / First entry.
  60.  
  61. [ 1] Tanabe Y., Masu M., Ishii T., Shigemoto R., Nakanishi S.
  62.      Neuron 8:169-179(1992).
  63. [ 2] Okamoto N., Hori S., Akazawa C., Hayashi Y., Shigemoto R., Mizuno N.,
  64.      Nakanishi S.
  65.      J. Biol. Chem. 269:1231-1236(1994).
  66. [ 3] Brown E.M., Gamba G., Riccardi D., Lombardi M., Butters R., Kifor O.,
  67.      Sun A., Hediger M.A., Lytton J., Hebert Sc.
  68.      Nature 366:575-580(1993).
  69.